Manga Big Order bercerita seputar seorang siswa SMA introvert bernama Eiji Hoshimiya yang memiliki sebuah rahasia besar, yaitu dia mengharapkan kehancuran dunia saat masih kecil. Peri kemudian memberikan beberapa orang terpilih sebuah kekuatan bernama Order. Para pengguna Order kemudian dapat menggunakan kekuatannya sesuai keinginan mereka. 10 tahun setelah Great Destruction, Eiji berusaha untuk mengendalikan kekuatannya yang luar biasa besar.